Normalerweise sind über den Proxy nur Zugriffe auf die Zielports 21 und 80, sowie auf 443 für SSL erlaubt. Der Grund dafür ist, dass man die CONNECT-Funktion des Proxys generell auch für andere Protokolle als HTTP nutzen kann und daher eventuelle Firewall-Beschränkungen umgangen werden könnten. Einige Webserver verwenden aber auch andere Ports, wie z.B. 81, 8080 usw. Sollen die Clients diese benutzen können, so müssen sie unter Dienste > Proxy > Einstellungen in die Felder "" bzw. "" eingetragen werden.
Normalerweise greift der Proxy direkt auf die angeforderten Server im Internet zu. Es ist allerdings auch möglich, dass das Intra2net System alle Anfragen an einen anderen Proxy weiterleitet (Parent-Proxy). Dieser kann unter Netzwerk > Provider > Profile : Dienste konfiguriert werden. Damit kann für jeden Provider ein unterschiedlicher Proxy verwendet werden.